h/f chercheur.e cdd postdoctoral en génomique des populations et spéciation
Detail de l'annonce :
Date Limite Candidature : samedi 9 juillet 2022
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INFORMATIONS GÉNÉRALES
Référence : UMR5554-CARSMA-002
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : samedi 18 juin 2022
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 13 mois
Date d'embauche prévue : 15 novembre 2022
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 2739€ et 3869€ brut mensuel / mois en fonction de
l'expérience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
MISSIONS
Nous recherchons un.e post-doctorant.e ayant une expérience en
génomique des populations pour travailler sur un projet financé par
l'ANR (ANR MECADAPT) portant sur les mécanismes d'adaptation et de
spéciation chez une espèce phytophage, le puceron du pois
(Acyrthosiphon pisum). Cette espèce de ravageur est un système
modèle dans les études de spécialisation écologique et de
spéciation en raison de son complexe de biotypes spécialisés dans
les plantes qui forment un continuum de divergence entre les races
hôtes étroitement apparentées et les espèces naissantes. Le/la
postdoctorant.e sera en charge des études de génomique des
populations pour explorer l'histoire évolutive de la formation et de
la diversification des biotypes dans le complexe du puceron du pois.
ACTIVITÉS
Vous serez amené à effectuer des analyses de données NGS (données
de séquençage poolseq et individuelles de génomes entiers) afin de
réaliser :
(1) des inférences démographiques pour reconstruire l'histoire
évolutive et démographique de la diversification des biotypes
(2) des analyses de différenciation génomique afin de caractériser
les loci impliqués dans l'isolement reproductif et la dynamique de la
différenciation génomique au fur et à mesure que la spéciation se
déroule.
Des ensembles de données constitués de plus de 200 génomes
reséquencés regroupés et individuels à partir d'échantillons
mondiaux seront disponibles au début du projet et seront étendus au
cours du projet.
Vous serez également amener à valoriser les résultats obtenus sous
forme de communications orales à des conférences et d'articles
scientifiques.
COMPÉTENCES
Les candidats doivent avoir un doctorat dans un domaine pertinent
(biologie évolutive, génomique des populations). Nous recherchons
une personne ayant un vif intérêt pour la biologie évolutive et la
recherche sur la spéciation/adaptation et possédant une solide
expérience en génomique des populations et en génétique
statistique. Une expérience dans le traitement des données
génomiques et des méthodes de génomique des populations, ainsi que
des compétences en bioinformatique et en programmation sont requises.
Une expérience déjà établie dans l'utilisation des méthodes
d'inférence démographique sera un point fort. Les candidats doivent
avoir d'excellentes compétences en anglais écrit et parlé pour
pouvoir communiquer les résultats de son travail.
CONTEXTE DE TRAVAIL
Le poste sera basé à l'ISEM (Institut des Sciences de l'Evolution de
Montpellier), à Montpellier, France, en forte interaction avec le
CBGP (Centre de biologie pour la gestion des populations). Le postdoc
travaillera en étroite collaboration avec Carole Smadja (ISEM),
Emmanuelle Jousselin (CBGP), Mathieu Gautier (CBGP) et Renaud Vitalis
(CBGP) et bénéficiera de l'expertise disponible en génomique des
populations, spéciation/adaptation génomique et évolution et
biologie des pucerons à l'établissement d'accueil. Le postdoc
collaborera également avec les autres partenaires du projet ANR
basés à Rennes (Jean-Christophe Simon, Julie Jaquiéry, Fabrice
Legeai à l'IGEPP – INRAE), à Poitiers (Jean Peccoud à l'EBI –
Université de Poitiers). Le postdoc bénéficiera donc d'un réseau
collaboratif riche, ainsi que d'un environnement de travail stimulant
à Montpellier, pôle d'excellence en recherche sur la biodiversité
et reconnu pour sa qualité de vie en région méditerranéenne.